VAROITUS: Seuraava sisältää spoilereita Viimeinen meistä osa II.
Sisään Viimeinen meistä osa II , pelaajat hallitsevat sekä Ellieä että Abbyä, kun he vuorotellen tekevät julmuuksia toisiaan vastaan koston nimissä. Sykli on näennäisesti loputon. Aluksi Abby esitetään pelin roistona. Hän kiduttaa ja lopulta tappaa Joelin golfmailalla - sen pitäisi riittää, että sekä pelaaja että Ellie haluavat nähdä saman tekevän hänelle.
Peli kuitenkin osoittaa lopulta, että asiat eivät ole niin selkeitä kuin miltä ne näyttävät. Kyllä, Abby murhasi Joelin. Mutta hän tekee sen murhatun isänsä ja mahdollisuuden rokottaa. Ellie puolestaan hylkää kaikki rakkaansa useaan otteeseen Abbyn tappamiseksi. Kuka olet juurtunut viimeiseen lopputulokseen, riippuu suurelta osin uskomuksistasi ja uskollisuudestasi, joita pidät ensimmäisestä pelistä.
Kolmen raskaan ja kuolemaa uhmaavan päivän jälkeen Seattlessa Abby ja Ellie kohtaavat lopulta teatterissa. Abby on tullut tavoitteenaan tappaa ystävänsä murhannut henkilö. Hän matkustaa vasta orvoiksi jääneen serafitin, Levin kanssa. Samaan aikaan Ellie pohtii, pitäisikö hänen mennä vielä kerran Abbyn jälkeen vai palata Jacksoniin. Viime kädessä hän on liian myöhäistä. Abby murtautuu ja tappaa Jessen ja melkein kaikki muut. Ilman Levin vetoomusta, hän todennäköisesti olisi.
Jacksonissa palanneet Ellie ja Dina elävät Dinan unelmasta. Maalaistalo Jacksonin ulkopuolella, josta on kaunis näköala ja Jessen poikavauva JJ. Se ei kuitenkaan ole tarpeeksi hyvä Ellielle. Tommy palaa johtoasemassa Abbyn olinpaikkaan, ja Ellie lähtee siitä huolimatta, että Dina pyysi häntä pysymään ja vihjaisi, että jos Ellie lähtee, he ovat molemmat valmiit.
Santa Barbarassa Abby ja Lev ovat asuneet purjeveneestä. He löytävät entisen Fireflies-kasarmin ja löytävät yhteyden radio-operaattoriin, joka kertoo heille, että kaksisataa Fireflies-ryhmää on muodostunut uudelleen Catalina-saarella. Mutta asiat menevät pieleen, kun Rattleriksi kutsuttu jengi vangitsee ne.
Ellie jäljittää veneen ja törmää sitten Rattlersiin. Lopulta hän huomaa Abbyn pidettävän kompleksissa Santa Barbarassa. Hän löytää Abbyn, joka on kiinnitetty 'Pylväisiin' rangaistuksena pakenemisyrityksestä, ja leikkaa hänet. Abby kaataa Levin ja kertoo Ellielle, että lähellä on ankkuroituja veneitä. Ellien veri muistuttaa häntä Joelista, ja hän vaatii Abbyä taistelemaan häntä meressä. Abby kieltäytyy aluksi, ja Ellie uhkaa tappaa Levin, joka pitää kiinni elämästä. He taistelevat, kun Ellie lopulta hukuttaa Abbyn, kunnes visio Joelista, tällä kertaa terve ja elävä, napsahtaa hänet pois siitä. Hän päästää Abbyn ja Levin menemään ja palaa maatilalle vain kolmella sormella vasemmassa kädessään, hinta hänen kostostaan.
Maalaistalo on täysin tyhjä, lukuun ottamatta Ellien taidestudiota, toinen merkki, jonka Dina ei odottanut hänen takaisinsa. Ellie istuu alas ja soittaa karkean version samasta kappaleesta, jonka Joel soitti hänelle, kykenemättä soittamaan kaikkia sointuja vahingoittuneella kädellään.
Tästä lopusta on selvää, että Ellien kosto on maksanut hänelle melkein kaiken. Hän menettää perheensä ja ystävänsä Jessen. Hän menettää näennäisesti rauhallisen elämän. Hän menettää suurimman osan kyvystään soittaa kitaraa, mikä oli yksi tapa, jolla hän käsitteli tunteitaan ja muisti Joelin. Hänellä on onni paeta elämästään. Mutta Joelin muisti on myös pelastanut hänen ihmiskuntansa. Hän - toivottavasti - on oppinut, että kosto ei ratkaise mitään.
Abby puolestaan oli jo oppinut tuon oppitunnin Seattlessa. Hän huolehtii ilmeisesti Levistä samalla tavalla kuin Joelilla oli Ellie. Hän kantaa jopa Leviä kuten Joel vei Ellien pois sairaalasta ensimmäisessä pelissä. Levin ja Abbyn hyvää loppua toivovat toivovat pääsevänsä Catalina-saarelle, kun taas Ellielle hyvää loppua toivovien on pohdittava, mitä tämä voi tarkoittaa.
Ellie voisi palata Jacksoniin ja yrittää tehdä hyvityksen Dinan kanssa, vaikka ei ole selvää, onko se mahdollista. Hänellä on edelleen Tommy, joka vie aikaa vaimoaan lukuun ottamatta, mutta onko hän anteeksi hänelle Abbyn päästämisen, on toinen kysymys. Saammeko nähdä enemmän Ellien tarinaa, ehkä a Osa III , koston päästäminen irti ja muistojen pitäminen Joelista ovat tärkeitä askeleita kohti lopulta itselleen rauhan löytämistä.