Siitä huolimatta Naruto keskittyy ensisijaisesti Nuoreen Uzumakin päähenkilöön, sarja on täynnä mielenkiintoisia toissijaisia merkkejä . Yksi hieno asia Naruto on, että fanit saavat välähdyksiä myös sivuhahmojen elämään. Shinobi-maailma on vaarallinen paikka, ja nuorten shinobien on opittava navigoimaan siinä.
Harjoittelemalla ja opiskelemalla Naruto ja hänen ystävänsä oppivat olemaan taitava ninja. Nuoret shinobit ovat onnekkaita kouluttamaan voimakkaiden mestareiden johdolla. Koko sarjassa on monia tapauksia, joissa nuoret oppisopimusopiskelijat ylittävät usein opettajansa.
10Orochimaru ylittää Hiruzenin
Orochimaru on orpo, joka harjoittelee Hiruzen Sarutobin johdolla. Häntä pidetään sukupolvensa ihmeenä, jolla on suuri nerous ja taito. Hänen itsepalvelunsa edut ja kyltymätön halu hankkia kaikki maailman salaisuudet johtavat hänet pimeään polkuun.
Hiruzen huomaa, että Orochimaru tekee epäeettisiä kokeita, mutta eikä tappanut häntä , hän antaa hänen paeta. Orochimaru asettaa elämäntavoitteekseen kuolemattomuuden hankkimisen oppimaan kaikki jutsut maailmassa, jotta hän voi jonain päivänä kostaa entiselle mestarilleen. Tapaaminen huipentuu Konoha Crushiin, jossa Orochimaru tappaa Hiruzenin.
9Minato ylittää Jiraiyan
Lehtikylän keltaisena salamana tunnettu Minato kouluttaa Jiraiyan alla. Hän erottuu poikkeuksellisena shinobina, joten Jiraiya ottaa Minaton oppisopimuskoulutukseen. Jiraiyan johdolla Minato oppii monet entisen ainutlaatuisista taidoista, jopa luomalla oman allekirjoituskykynsä, Rasenganin.
Undercover shutdown ale
Minatosta tulee yksi maailman historian tehokkaimmista shinobista. Hänen nimensä herättää pelkoa muissa ja suorituskyky sodan aikana turvaa hänelle Hokagen arvonimen. Hän on yksin vastuussa lehtikylän suojelemisesta yhdeksän pyrstön hyökkäyksen aikana, uhraamalla henkensä pelastaa Konoha.
8Shikamaru ylittää Asuman
Shikamarua pidetään laiskana löysänä. Hänen opettajansa Asuma uskoo kuitenkin, että Shikamaru on oikeastaan melko älykäs ja asettaa älykkyytensä tehtäväksi testien avulla. Asuma huomaa, että Shikamaru on todella nero, ja hänen ohjauksellaan Shikamaru ottaa enemmän vastuuta.
Asuma, samoin kuin Viides Hokage, vakuuttaa Shikamarun käyttämään taitojaan ja älykkyyttään paitsi ystäviensä, myös kylän hyödyttämiseksi. Asuman kuoleman jälkeen Shikamaru ymmärtää, että maailma ei ole turvallinen paikka, ja hän sitoutuu tekemään shinobi-maailmasta paremman paikan tuleville sukupolville.
7Sasuke ylittää Orochimarun
Orochimaru vetää puoleensa Sasukea, koska hän uskoo tekevänsä sopivan aluksen, jolloin Orochimaru voi jatkaa asumistaan. Sasuke on taitava ja kykenevä shinobi, joka osoittaa lapsen ihmeen ominaisuuksia.
Orochimaru rekrytoi onnistuneesti Sasuken ja alkaa opettaa hänelle kaikkea mitä tietää. Paitsi että Sasuke kasvaa yhdeksi tehokkaimmista shinobista, jota vain Naruto kilpailee, hän pystyy myös ohittamaan Orochimarun ja tappamaan hänet.
6Killer B ylittää Raikagen
Kolmas Raikage värvää B: n A: n tag-kumppaniksi, joka pyrkii suorittamaan Double Lariat -tekniikan. B: stä tulee lopulta Gyukin jinchuriki ja hän harjoittelee veljensä A kanssa saaden täydellisen hallinnan bijuunsa hyvin lyhyessä ajassa.
Neljännen suuren Shinobi-sodan aikana A yrittää estää B: tä ja Narutoa etenemästä taistelukentälle. B kertoo A: lle, että vaikka hän ei katsellut, hän on ylittänyt hänet. Kun molemmat törmäävät ensin, A tajuaa, että hänen veljestään on tullut häntä voimakkaampi, ja päästää hänet ohi.
5Gaara ylittää Isänsä
Ennen Gaaran syntymää yksisuuntainen peto asetetaan hänen sisäänsä. Jo ennen syntymää Gaara valittiin hiekkakylän aseena. Hänen syntymänsä jälkeen, huolimatta harjoittelustaan, on ilmeistä, että hän ei pysty hallitsemaan hännän pedoa sisällä.
Gaaran isä käskee pojan setän tappamaan hänet. Epäonnistumassa tehtävässään hän kertoo Gaaralle, ettei häntä koskaan rakastettu. Tämän tapahtuman jälkeen Gaara keskittyy yksinomaan itseensä ja lopulta saa hallintaansa hännän pedosta, josta tulee ase, jonka isä aina tarkoitti hänen olevan.
4Nagato ylittää Jiraiyan
Nagato ja hänen ystävänsä, Yahiko ja Konan, ovat kouluttanut ja hoitanut Jiraiya sen jälkeen, kun he ovat orpoja toisessa Shinobin maailmansodassa. Rinneganinsa ansiosta Nagato pystyy oppimaan ja hallitsemaan koulutuksensa hyvin nopeasti. Kun Jiraiya on tyytyväinen heidän edistymisensä, hän jättää Nagaton ja hänen ystävänsä.
Kolme muodostavat Akatsukin toivoen rauhallisemman maailman luomisen, mutta Yahikon kuoleman jälkeen Nagato ottaa Kipu-identiteetin ja muodostaa Akatsukin joksikin väkivaltaisemmaksi. Nagato manipuloi voimaansa ja chakraansa kuudennet kivun polut ja lopulta tappaa Jiraiyan.
3Sasori ylittää Chiyon
Kun hänen vanhempansa on tapettu, Sasori kasvaa isoäitinsä Chiyo. Piilotetun hiekan kylän nukemestari Chiyo esittelee nukketeatterin Sasorille. Hän on niin menestynyt nukkeissaan taistelun aikana, että hänet kutsutaan Punaisen hiekan Sasoriksi.
Kylmyyden ja ihmiselämän välinpitämättömyyden vuoksi Sasori vertaa itseään nukkeihin. Hän jopa kehittää keinon ihmisten nukkeja ylittäen Chiyon kyvyt. Hänellä on ja on ainoa, jolla on ihmisen nukketeatterin salaisuudet.
kaksiNaruto ylittää Jiraiyan
Jiraiya kouluttaa monia shinobeja koko sarjan ajan, mutta yksikään ei ole yhtä tärkeä kuin Naruto. Isänsä Minaton tavoin Jiraiya välittää tekniikoitaan Narutolle. Jiraiya tuntee vastuun suojella ja opettaa Narutoa kummisetä.
Yksi asia, jonka Jiraiya auttaa Narutoa oppimaan, on se, kuinka kutsua rupikonnat Mt. Myoboku. Jiraiya vie myös Naruton Mt. Myoboku kouluttaa. Toisin kuin Jiraiya, Naruto oppii hallitsemaan täysin Sage-tilan ja käyttää sitä usein koko sarjan taisteluissa.
1Kabuto ylittää Danzon
Kabuto värvätään nuorena orpokodista Danzo's Root -järjestöön. Hän koulutti useita vuosia vakoojana ja tunkeutuu moniin kyliin saadakseen älykkyyttä. Kun hän saa tietää, että Danzo tarkoitti häntä tahallaan entisen orpokodin tuttavansa vastaan, Kabuto lähtee juuresta ja liittyy Orochimaruun.
Orochimarun oletetun kuoleman jälkeen Kabuto alkaa muokata omaa ruumiinsa täydelliseksi olennoksi. Hänen kokeilunsa avulla hän voi toistaa muiden allekirjoitustaidot, jopa kekkei genkai, ja hallita ja käyttää Sage-tilaa. Danzon taidot eivät ole mitään verrattuna Kabuton kykyihin.