Kapteeni Amerikka: sisällissota paljasti monia pimeitä salaisuuksia, jotka ympäröivät joitain elokuvan merkittävimpiä hahmoja. Suurin paljastus oli, että talvisotilas (Sebastian Stan) tappoi Tony Starkin (Robert Downey Jr.) vanhemmat, mutta elokuvassa oli paljon muita ilmoituksia. Esimerkiksi Peggy Carterin (Hayley Atwell) kuolema esitteli omia paljastuksiaan sekä teatterileikkauksessa että sen poistetuissa kohtauksissa.
Peggyn hautajaisten aikana Sharon Carter (Emily VanCamp) paljasti olevansa Steve Rogersin (Chris Evans) vanhan liekin veljentytär, mutta tämä ei ollut ainoa perheen salaisuus, josta sankari sai tietää. Kun hän vietti aikaa kirkossa yksin käsittelemällä Peggyn kuolemaa, Natasha Romanoff (Scarlett Johansson) käveli sisään varmistaakseen, että hänen ystävänsä ei ollut yksin. Vaikka teatterileikkaus oli lyhyt keskustelu, joka liittyi siihen, kuka oli allekirjoittanut ja mitkä eivät allekirjoittaneet Sokovia-sopimuksia, poistettu kohtaus sisälsi suuren osan Mustan lesken menneisyydestä.
Steve kertoi kohtauksessa kuinka yllättyi siitä, että Peggy oli vielä elossa, kun hän tuli ulos jäästä. Natasha muistutti häntä siitä, kuinka tärkeää Peggyllekin oli, että nämä kaksi pystyivät muodostamaan yhteyden, kun vielä oli aikaa. Nat selitti myös, kuinka hänen päätöksensä katoaa ja löytää uusi identiteetti seurauksena Kapteeni Amerikka: Talvisotilas sidottu siihen, mitä Steve tunsi.
S.H.I.E.L.D: n romahtamisen jälkeen Natasha päätti mennä tutustumaan perheeseensä. Poistettu kohtaus, '' Peggy's Extended Funeral '', syvensi enemmän totuuteen vanhempiensa kohtalosta. Kuten hän selitti, Natin etsintä johti hänet kahteen hautakiveen ketjun aidalla. Sulkeutumisen muodossa Nat veti rikkaruohoja ja jätti kukkia hautausmaalle. Hän päätti tarinansa muistuttamalla Stevea siitä, että 'meillä on mitä meillä on, kun meillä on se'.
Natin hahmo rakennettiin menetykseen ja sinnikkyyteen. Hän menetti yhden perheen Talvisotilas kun S.H.I.E.L.D. hänet purettiin, mutta hän nojautui Avengersiksi toisena kotona, johon hänellä voisi olla vaatimus. Hän muistutti Stevea siitä, että tärkeä asia oli hänen rakastamiensa ihmisten kanssa viettämä aika, jota Nat ei koskaan saanut vanhempiensa kanssa. Sokovia-sopimuksella hänen perheensä uhkasi jälleen ja väistämättä jakaa keskellä. Viime kädessä hänen kuolemansa vuonna Kostajat: Loppupeli oli jotain, joka auttoi heitä palaamaan yhteen.
Kapteeni Amerikka: sisällissota osoitti, että Mustan lesken todelliset uskollisuudet olivat hänen perheellään. Hänen päätös vaihtaa puolta kolmannessa näytöksessä oli loistava esimerkki tästä. Poistettu kohtaus, jossa hän keskusteli kuolleista vanhemmistaan, auttoi kuitenkin lisäämään toisen kerroksen keskittymiseen perheeseen samalla, kun hän ennakoi kääntöään myöhemmin elokuvassa. Valitettavasti Marvel Cinematic Universumin poistettuja kohtauksia ei pidetä kaanonina, joten on epäselvää, kulkeeko tämä tieto tärkeimpään jatkuvuuteen.
